RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)
产品名称: RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)
英文名称: RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)
产品编号: 41309ES96
产品价格: 2695.00
产品产地: Yeasen
品牌商标: Yeasen
更新时间: 2024-12-10T11:21:51
使用范围: null
规格 | 价格 |
1x96T | 2695.0 |
5x96T | 11315.0 |
- 联系人 : 李自转
- 地址 : 上海市浦东新区天雄路166弄一号楼三层南单元
- 邮编 : 200030
- 所在区域 : 上海
- 电话 : 139****5640 点击查看
- 传真 : 点击查看
- 邮箱 : lizizhuan@yeasen.com
- 二维码 : 点击查看
产品简介
RNase活性检测试剂盒(荧光标记法)使用一种新型RNA底物,其一端标记有荧光报告基团分子(Fluor),另一端标记有淬灭基团。在不存在RNase时,淬灭基团的物理接近会将荧光报告基团中的荧光淬灭到极低水平。当有RNase时,RNA底物被水解,荧光报告基团和淬灭基团在溶液中的空间上发生分离,这导致Fluor在被适当波长的光激发时发出明亮的荧光,该荧光可以通过多功能酶标仪(含荧光模块)和基于滤光片或单色器的荧光计进行检测。
RNase活性检测试剂盒(荧光标记法)采用底物荧光标记法,可定量或定性的检测单个样品中的RNase,从而判断样本是否有RNase污染。
产品信息
货号 |
41309ES96 / 41309ES97 |
规格 |
1×96 T / 5×96 T |
组分信息
组分编号 |
组分名称 |
41309ES96 |
41309ES97 |
41309-A |
RNase Substrate |
1 tube |
5×1 tube |
41309-B |
10×RNase buffer |
1 mL |
5 mL |
41309-C |
RNase A (≈1×10-4 U/μL) |
100 μL |
500 μL |
41309-D |
DEPC-treated Water |
10 mL |
50 mL |
41309-E |
Surface RNase Remover |
50 mL |
250 mL |
运输和储存条件
1. 所有组分均干冰运输,有效期1年。
2. 收到货后,请先检查共5个组分是否齐全,再将41309-E组分2-8℃保存,其它组分-25~-15℃保存,避免反复冻融。
注意事项
1. 本产品仅作科研用途。
2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
3. 使用本试剂前请仔细阅读本说明书,实验应规范操作,包括样本处理、反应体系的配制及加样。
4. 每个组分在使用前都应充分震荡混匀,低速离心。
5. 加样和配液步骤请严格在冰上操作,以减缓上机前酶对底物的消耗。
6. 实验需使用低吸附耗材以降低酶损耗。
7. 定量实验需使用黑色酶标板以最大程度减少本底荧光。
使用说明
1. 适用机型
包含但不限于以下仪器:
Thermo Scientific: Invitrogen Qubit 4;
Molecular Devices: SpectraMax M3.
2. 实验前准备
1)在整个实验开始前,请先使用试剂盒中的Surface RNase Remover对实验环境进行处理(可稀释10倍进行喷洒或擦拭,具体可参考翌圣10609ES60使用说明书),以降低RNase污染。
2)本品可对具备活性的RNase进行检测及估值,在实验过程中可根据实际情况选择定性检测或者定量检测方法。
3. 定性检测方法
使用终点法在荧光仪或酶标仪上对待测样本进行读数,以Thermo公司Invitrogen Qubit 4荧光仪为例:
1)溶解RNase Substrate:取1管RNase Substrate干粉,高速离心,缓慢打开瓶盖加入1 mL DEPC-treated Water备用。
2)配制反应体系:每次实验均需制备阴性对照、阳性对照和待测样本体系。具体操作如下(按顺序加入下列试剂并混匀):
阴性对照反应体系 |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
160 |
10×RNase buffer |
20 |
RNase Substrate |
20 |
总体积 |
200 |
表1 阴性对照反应体系
阳性对照反应体系 |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
140 |
10×RNase buffer |
20 |
RNase Substrate |
20 |
5 pg/μL RNase A* |
20 |
总体积 |
200 |
表2 阳性对照反应体系
*试剂盒C组分的RNase A参考品稀释20倍约为5 pg/μL的RNase A。
待测样本反应体系 |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
140 |
10×RNase buffer |
20 |
RNase Substrate |
20 |
待测样本 |
20 |
总体积 |
200 |
表3 待测样本反应体系
*若待测样本污染较轻可增加待测样本体积,最大可增加至160 μL,相应减少DEPC-treated Water添加量,最小可减少至0,保持总体积不变。
3)检测初始荧光值:以Qubit4为例,对阴性对照、阳性对照和待测样本进行检测,选择“Fluorometer”进入荧光检测界面后,再选择“Blue”进行检测,并记录初始荧光值“RFU0”。
4)37℃孵育读值:将阴性对照、阳性对照和待测样本均放入37℃恒温箱孵育60 min后,重复步骤3,记录终末荧光值“RFU60”。5)结果判读:若阴性对照荧光值孵育前后变化不超过50%,阳性对照RFU60远大于2RFU0,且待测样本RFU60≥2RFU0,则判定待测样本被RNase污染。
4. 定量检测方法
使用多功能酶标仪对RNase进行实时监测并定量,使用此方法可以获得RNase消化底物的实时曲线。以Molecular Devices公司SpectraMax M3多功能酶标仪为例:
1)溶解RNase Substrate*:取1管RNase Substrate干粉,高速离心,缓慢打开瓶盖加入1 mL DEPC-treated Water备用,该干粉加入DEPC水后,可分装置于-25~-15℃短期保存(不超过3个月),使用时避免反复冻融。
2)稀释RNase A**:对试剂盒中RNase A梯度稀释,浓度依次为5 pg/μL、2.5 pg/μL、1 pg/μL、0.1 pg/μL。操作如下:
a. 取1.5 mL洁净离心管,加入495 μL DEPC-treated Water,再加入5 μL 10×RNase buffer,即获得500 μL 0.1×RNase buffer,用于后续配置梯度稀释液,配置前请将溶液轻微振荡混匀。
b. 取5支洁净的1.5 mL离心管,分别标记为Std0、Std1、Std2、Std3、Std4。
c. 在标记为Std0***的1.5 mL离心管中加入45 μL 0.1×RNase buffer和5 μL试剂盒中提供的RNase A(≈1×10-4 U/μL),即稀释为10 pg/μL(≈1×10-5 U/μL)的RNase A。
d. 在Std1、Std2、Std3、Std4管中先分别加入下表所示体积的0.1×RNase buffer,再进行梯度稀释,具体稀释方法如下:
稀释管 |
稀释比例 |
终浓度 |
Std1 |
30μL Std0 + 30μL 0.1×RNase buffer |
5 pg/μL |
Std2 |
30μL Std1 + 30μL 0.1×RNase buffer |
2.5 pg/μL |
Std3 |
20μL Std2 + 30μL 0.1×RNase buffer |
1 pg/μL |
Std4 |
5μL Std3 + 45μL 0.1×RNase buffer |
0.1 pg/μL |
表4 标准品梯度稀释
*为减少反复冻融次数和避免污染,建议初次使用时将稀释好的RNase Substrate分装储存于-25~-15℃。
**已知试剂盒中的RNase A浓度为≈1×10-4 U/μL,且对于RNase A的单位U和pg的换算关系为5×10-7 U≈0.5pg。
***Std0配制:将试剂盒中RNase A由1×10-4 U/μL稀释至1×10-5 U/μL,因5×10-7 U≈0.5pg,则1×10-5 U≈10pg,故1×10-5 U/μL≈10pg/μL。
3)标准品和待测样本的反应体系配制:
a. 标准品和阴性对照的Mix混合液配制:通常包括4个浓度梯度的RNase A参考品标准曲线和1个无模板对照NTC共5个样本,每个样本2个重复孔,再加1孔的损失量,共计11个孔。具体操作如下(按顺序加入下列试剂并混匀):
Mix混合液 |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
770 (11*70) |
10×RNase buffer |
110 (11*10) |
RNase Substrate |
110 (11*10) |
总体积 |
990 (11*90) |
表5 Mix混合液配制体系
标准品和阴性对照反应体系配制:将上述配制的Mix混合液以90 μL/孔进行分装,再添加10 μL/孔稀释好的RNase A参考品或10 μL/孔的阴性对照(可用0.1×RNase buffer作为阴性对照)。具体操作如下:
标准品反应体系 |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
70 |
10×RNase buffer |
10 |
RNase Substrate |
10 |
RNase A参考品梯度稀释液 |
10 |
总体积 |
100 |
表6 标准品反应体系
阴性对照反应体系 |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
70 |
10×RNase buffer |
10 |
RNase Substrate |
10 |
0.1×RNase buffer |
10 |
总体积 |
100 |
表7 阴性对照反应体系
b. 待测样本反应体系配制(按顺序加入下列试剂并混匀):
待测样本反应体系 |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
70 |
10×RNase buffer |
10 |
RNase Substrate |
10 |
待测样本* |
10 |
总体积 |
100 |
表8 待测样本反应体系
*若待测样本污染较轻可增加待测样本体积,最大可增加至80 μL(待测样本的本底检测与之保持一致),相应的减少DEPC-treated Water添加量,最小可减少至0,保持反应体系总体积不变。
c. 待测样本的本底检测反应体系配制:
待测样本的本底反应体系* |
体积(μL) |
DEPC-treated Water |
90 |
待测样本** |
10 |
总体积*** |
100 |
表9 待测样本的本底反应体系
*建议每次进行RNase活性检测时,针对每个初次测试的待测样本都增加不含RNase Substrate的本底荧光检测,若本底荧光偏高则计算时应减去。
**每次进行RNase活性检测实验时,标准品、阴性对照、待测样本、待测样本的本底检测等都至少做2个重复孔。
***为确保检测的准确性,所有样本进行加样时,请务必在冰上操作。
4)下表为参考板位:
|
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
11 |
12 |
A |
标准曲线Std1 |
标准曲线Std1 |
|
待测样本TS1 |
待测样本TS1 |
TS1本底检测 |
TS1本底检测 |
|
|
|
|
|
B |
标准曲线Std2 |
标准曲线Std2 |
|
待测样本TS2 |
待测样本TS2 |
TS2本底检测 |
TS2本底检测 |
|
|
|
|
|
C |
标准曲线Std3 |
标准曲线Std3 |
|
待测样本TS3 |
待测样本TS3 |
TS3本底检测 |
TS3本底检测 |
|
|
|
|
|
D |
标准曲线Std4 |
标准曲线Std4 |
|
待测样本TS4 |
待测样本TS4 |
TS4本底检测 |
TS4本底检测 |
|
|
|
|
|
E |
|
|
|
待测样本TS5 |
待测样本TS5 |
TS5本底检测 |
TS5本底检测 |
|
|
|
|
|
F |
|
|
|
待测样本TS6 |
待测样本TS6 |
TS6本底检测 |
TS6本底检测 |
|
|
|
|
|
G |
|
|
|
待测样本TS7 |
待测样本TS7 |
TS7本底检测 |
TS7本底检测 |
|
|
|
|
|
H |
NTC |
NTC |
|
待测样本TS8 |
待测样本TS8 |
TS8本底检测 |
TS8本底检测 |
|
|
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表10 上机参考板位
该示例是对RNase活性检测的荧光标记法的操作展示,检测样本包括:4个浓度梯度的RNase A标准曲线、1个无模板对照NTC、8个待测样本TS、8个待测样本对应的本底检测。建议每个样本做2个重复孔。
5)仪器设置:使用酶标仪进行本实验,选择96孔板动力学模式以及荧光检测模块,选择中等增益,设置激发光490 nm,发射光520 nm;以1 min间隔读取数据,37℃恒温连续读数1 h(视待测物污染情况而定),此方法可实时监控体系动态。
6)结果判读:
a. 若RFU60≥2RFU0,则判定待测样本被RNase污染。
b. 若判定样本已污染,则制作标准曲线检测待测样本RNase污染含量(以下示例显示总体系的污染含量,如:标准品5 pg/μL,加样量10 μL,即总体系含量50 pg):
c. 以标准品开始读数时的前几分钟(可从时间曲线上判断线性增长期并选择合适的时间点,如下图一般选择0-3 min)所得数据制作标准曲线,再结合标准曲线和待测样本在此时间点的荧光值可得其RNase污染的估值,也可通过实时荧光曲线趋势判断待测样本中RNase的污染情况。
d. 示例:已知待测样本的RFU60≥2RFU0,选择2 min时标准品各稀释梯度对应的RFU制作标准曲线(如下图),将待测样本2 min时的RFU值代入标曲公式,即得待测样本整体的RNase活性浓度。
【注】:
- 该试剂盒测定的是待测样本体系整体的RNase活性残留。
- 试剂盒利用RNase对底物特异性切割的特性进行检测,因此具有使蛋白质变性及含有使RNA单链断裂的物质不适用此试剂盒。
- 深色液体会对荧光收集产生影响,可能会影响结果准确性。
- 部分待测样本由于过酸、过碱或盐离子浓度过高抑制RNase的活性,可视情况对待测样本进行稀释后检测。
- 在使用定量方法检测时,仪器有时初始荧光值会虚高,请观察时间曲线选择最低荧光值作为RFU0进行污染判断。
Ver.CN20230816